Ja, das dürfte am Shutdown Mechanismus liegen. Wenn der VDR das Ausschalten auslöst, ruft er das shutdown Script mit zusätzlichen Parametern auf, über die der Timer gesetzt wird. Das fehlt wenn Kodi das Ausschalten auslöst.
Allerdings bin ich nicht ganz sicher, dass das Verhalten wirklich so ist. Falls ja, wird im /usr/bin/runkodi zum ausschalten das shutdown aufgerufen, und müsste durch ein "svdrpsend.sh HITK POWER" ersetzt werden. Dann dauert es zwar 5 Sekunden bis nach dem Ausschalt Befehl etwas passiert, aber dad Aufwecken wird gesetzt.