mdev -s sollte nur zur Initialisierung erforderlich sein. Später ruft der Kernel bei jedem HotPlug Ereignis das HotPlug Script auf, welches dann mdev aufruft. Wenn Logging auf >=2 eingestellt ist, schreibt dieses Script jedes Hotplug Ereignis in die /var/log/messages.
Stell doch mal Logging auf 2 und schau Dir dann das Logfile an, ob, wann und warum Deine Input Devices angelegt oder entfernt werden.
Die einzige Idee die ich grade habe ist, das diese Ereignisse auftreten, wärend das root Filesystem initialesiert wird. Da könnte es ein bis zwei Sekunden geben, in denen neu erstellte Devices verloren gehen. Um das zu testen kannst Du ein "mdev -s" am Anfang der /etc/init.d/rc.sysinit einfügen. Sollte das helfen werde ich mal schauen wie sich das Problem umgehen lässt.
Claus