Hi,
das Systemlaufwerk wird nur dann für die Aufnahmen verwendet, wenn kein Datenlaufwerk vorhanden ist, bzw. wenn das Gesamtlaufwerk zu klein ist, und deshalb kein Datenlaufwerk erstellt wird.
Vor jedem installieren von Paketen wird ein Snapshot angelegt. Es werden aber nur insgesamt 20 Snaphots aufbewahrt.
Es können auch manuell Snapshots erstellt bzw. gelöscht werden. Das geht über das Setup unter Snapshots. Die Snapshots sind aber nicht im Filesystem zu sehen. Dafür müsste die System Partition anders gemountet werden.
Wenn Deine Aufnahmen zeitweilig auf dem Systemlaufwerk gelandet waren, und zu diesem Zeitpunkt ein Snapshot erstellt wurde, dann wird der Platz nach dem Löschen der Aufnahmen nicht frei gegeben, weil er ja noch im Snapshot benötigt wird. Der wird erst wieder frei gegeben wenn der entsprechende Snapshot gelöscht wird.
Mal abgesehen von den Snapshots kannst Du so nachschauen wie viel Platz im aktuellen Ordner belegt wird:
du -hs *